中澳自贸协定原产地证明办理指南主要包括以下步骤：

一、了解中澳自贸协定

在开始办理原产地证明之前，需要了解中澳自贸协定的基本内容和规定。中澳自贸协定是指中国和澳大利亚两国签署的自由贸易协定，旨在取消或降低双方之间的关税和非关税壁垒，促进贸易便利化。

二、准备所需资料

在办理原产地证明时，需要准备一些必要的资料，包括出口产品的详细清单、商业发票、运输单据等。同时，还需要准备企业的相关证明文件，如企业营业执照、税务登记证等。

三、申请原产地证明

1. 在中国，可以向当地的海关或出入境检验检疫局申请原产地证明。在申请时，需要提供上述准备好的资料。

2. 申请表格需要填写完整、准确，包括出口产品的详细信息、生产企业的情况等。

3. 申请成功后，需要缴纳相关的证明费用。

四、审核和审批

当地的海关或出入境检验检疫局会对申请材料进行审核和审批。审核的内容包括产品的生产过程、原材料来源等是否符合中澳自贸协定的规定。如果申请材料齐全、符合要求，且产品符合中澳自贸协定的规定，那么就可以获得原产地证明。

五、使用原产地证明

获得原产地证明后，可以在中澳两国享受自贸协定的优惠待遇，包括降低或免除关税等。在进口澳大利亚的产品时，可以凭原产地证明享受相应的优惠政策。

以上就是办理中澳自贸协定原产地证明的基本流程和注意事项。具体操作可能因地区和产品类型而有所不同，建议在办理前先咨询当地的海关或出入境检验检疫局。