从零开始办理洪都拉斯FTA原产地证的步骤可以按照以下进行：

一、基本准备

1. 了解FTA协定：在开始办理之前，首先要了解洪都拉斯与中国之间的自由贸易协定（FTA）内容，包括其适用范围、关税减免情况等。

2. 确认出口商品：明确需要办理原产地证的商品，确保商品属于FTA协定范围内。

二、申请注册

1. 注册公司：如果尚未注册公司，需要先在洪都拉斯或中国注册公司。

2. 申请原产地证注册：向当地商务部门或相关机构申请原产地证注册，提交公司基本信息和出口商品信息。

三、办理原产地证

1. 填写申请表：按照洪都拉斯相关部门的要求，填写原产地证的申请表，包括公司信息、出口商品信息等。

2. 准备相关文件：准备与出口商品相关的文件，如合同、发票、装箱单、运输单据等。

3. 提交申请：将填写好的申请表和相关文件提交给当地商务部门或相关机构。

4. 等待审核：等待洪都拉斯相关部门审核申请，审核通过后即可领取原产地证。

四、注意事项

1. 确保信息的准确性：在填写申请表和准备相关文件时，要确保信息的准确性，避免因信息错误导致办理失败。

2. 遵守规定：在办理过程中，要遵守洪都拉斯和中国之间的FTA协定和相关规定，确保出口商品的合规性。

3. 持续关注政策变化：FTA协定和相关政策可能会发生变化，要持续关注相关政策变化，及时调整办理流程和策略。

以上就是从零开始办理洪都拉斯FTA原产地证的步骤和注意事项。具体办理流程可能因地区和具体情况而有所不同，建议在实际操作中与当地商务部门或相关机构进行沟通确认。